新书推介:《语义网技术体系》
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    发贴心情 [合集]有研究程序性死亡的吗 ?


    [合集]有研究程序性死亡的吗 ?         


    发信人: kingsyl (Molecular Machine To Be Studied), 信区: Bioinformatics
    标  题: [合集]有研究程序性死亡的吗 ?
    发信站: 北大未名站 (2004年03月21日20:32:25 星期天), 站内信件

    ───────────────────────────────────────
    作者  badgee (天篷), 信区: Bioinformatics                                    
    标题  有研究程序性死亡的吗?                                                 
    时间  北大未名站 (2003年10月04日15:57:48 星期六) , 站内信件                  
    ───────────────────────────────────────
        生命的存在,由生物化学反应维持,生物个体有规律地按照某个程序生、老、病、死
    ,然而,这个程序的完全由protein来执行,根据中心法则归根到底都是有DNA决定的。亦
    或可说成是某些gene决定的,控制的究竟是哪些片段(gene)?
        这个星球上有没有人在研究这个问题?
        生命的奥秘可以通过bioinfo解读吗?
        

    ───────────────────────────────────────
    作者  aroluna (☆小蟹成仙·好好修炼☆), 信区: Bioinformatics                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日16:01:28 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    呵呵
    早你之前已经有无数人问过这个问题了
    其实所谓的“异想天开”谁都可以
    不过你的这个似乎没有什么建设性呀:)

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    :     生命的存在,由生物化学反应维持,生物个体有规律地按照某个程序生、老、病、死
    : ,然而,这个程序的完全由protein来执行,根据中心法则归根到底都是有DNA决定的。亦
    : 或可说成是某些gene决定的,控制的究竟是哪些片段(gene)?
    :     这个星球上有没有人在研究这个问题?
    ~~~~~~~~~~千万不要设想你的想法在这个星球上是独一无二,或者高人一筹
                         的
    :     生命的奥秘可以通过bioinfo解读吗?
                  ~~~~~~~~~~~~~首先想问问你,你对bioinformatics了解有
                              多深刻呢?

    ───────────────────────────────────────
    作者  lylover (石之轩), 信区: Bioinformatics                                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日16:22:19 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    nod.,你可以想。但是怎么证明啊?
    【 在 aroluna (☆小蟹成仙·好好修炼☆) 的大作中提到: 】
    呵呵
    早你之前已经有无数人问过这个问题了
    其实所谓的“异想天开”谁都可以
    不过你的这个似乎没有什么建设性呀:)

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    :     生命的存在,由生物化学反应维持,生物个体有规律地按照某个程序生、老、病、死
    : ,然而,这个程序的完全由protein来执行,根据中心法则归根到底都是有DNA决定的。亦
    : 或可说成是某些gene决定的,控制的究竟是哪些片段(gene)?
    :     这个星球上有没有人在研究这个问题?
    ~~~~~~~~~~千万不要设想你的想法在这个星球上是独一无二,或者高人一筹
                         的
    :     生命的奥秘可以通过bioinfo解读吗?
                  ~~~~~~~~~~~~~首先想问问你,你对bioinformatics了解有

                              多深刻呢?

    ───────────────────────────────────────
    作者  badgee (天篷), 信区: Bioinformatics                                    
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日16:29:46 星期六) , 站内信件                  
    ───────────────────────────────────────
        我想,bioinformatics是通过计算机和信息学的工具和手段,结合数学、物理等学科
    的知识通过建立各种模型解决生命科学里的各种问题,模型建立起来可以被生命科学工作
    这利用其他生化手段验证,然后在各领域得到应用。从而推动生命科学乃至整个人类社会
    的发展。bioinfo里面有各种各样的工具软件,当然绝大部分我都没有掌握,因为我还只
    是在空想阶段。我想有一部分bioinfo的人员还是搞软件开发和应用的吧。我大致看过各
    学院bioinfo的研究方向,我个人只想做生命科学的理论研究。
        也许有不少漏掉的,等我想起来再补充。当然怎么敢在师兄面前谈深刻?
        之所以是interdiciplinary应该是因为需要用到多学科的知识吧。
        也许说我得了“妄想症”倒更确切些。平时说我想法奇怪的朋友和同学甚至老师多了

        因此被人shame惯了。 呵呵
        至于建设性的建议,我更不敢说了,估计有人听了会晕倒  :P
        请多加指教!!
      
    【 在 aroluna (☆小蟹成仙·好好修炼☆) 的大作中提到: 】
    : 呵呵
    : 早你之前已经有无数人问过这个问题了
    : 其实所谓的“异想天开”谁都可以
    : 不过你的这个似乎没有什么建设性呀:)
    :  ~~~~~~~~~~千万不要设想你的想法在这个星球上是独一无二,或者高人一筹
    :                      的
    :               ~~~~~~~~~~~~~首先想问问你,你对bioinformatics了解有
    :                           多深刻呢?

    ───────────────────────────────────────
    作者  invoker (junkDNA), 信区: Bioinformatics                                
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日16:44:44 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    interesting question, crazy( or stupid ?)idea.
    :)

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    :     生命的存在,由生物化学反应维持,生物个体有规律地按照某个程序生、老、病、死
    : ,然而,这个程序的完全由protein来执行,根据中心法则归根到底都是有DNA决定的。亦
    : 或可说成是某些gene决定的,控制的究竟是哪些片段(gene)?
    :     这个星球上有没有人在研究这个问题?
    :     生命的奥秘可以通过bioinfo解读吗?

    ───────────────────────────────────────
    作者  badgee (天篷), 信区: Bioinformatics                                    
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:12:40 星期六) , 站内信件                  
    ───────────────────────────────────────
    Please tell me why?  I won't be stupid again!
    Thank you!!
    【 在 invoker (junkDNA) 的大作中提到: 】
    : interesting question, crazy( or stupid ?)idea.
    : :)

    ───────────────────────────────────────
    作者  invoker (junkDNA), 信区: Bioinformatics                                
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:27:03 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    oh, forget what I said,
    I just believe the biologic system is much more complex than we thought.

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    : Please tell me why?  I won't be stupid again!
    : Thank you!!

    ───────────────────────────────────────
    作者  badgee (天篷), 信区: Bioinformatics                                    
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:31:04 星期六) , 站内信件                  
    ───────────────────────────────────────
    Thank you!
    I wish one day I have a chance to gather scientist all over the world to make
    it out.  
    That may be actually crazy!
    But I'm really good at modeling,I think.

    【 在 invoker (junkDNA) 的大作中提到: 】
    : oh, forget what I said,
    : I just believe the biologic system is much more complex than we thought.

    ───────────────────────────────────────
    作者  aroluna (☆小蟹成仙·好好修炼☆), 信区: Bioinformatics                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:32:50 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    great
    modeling?admire啊:)

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    : Thank you!
    : I wish one day I have a chance to gather scientist all over the world to make
    :  it out.  
    : That may be actually crazy!
    : But I'm really good at modeling,I think.

    ───────────────────────────────────────
    作者  invoker (junkDNA), 信区: Bioinformatics                                
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:36:26 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    Bless

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    : Thank you!
    : I wish one day I have a chance to gather scientist all over the world to make
    :  it out.  
    : That may be actually crazy!
    : But I'm really good at modeling,I think.

    ───────────────────────────────────────
    作者  lylover (石之轩), 信区: Bioinformatics                                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:37:01 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    管别人说你什么?不用理那么多。看看你自己适合做什么。
    你在网上转了半天,好像还是在找门吧?不知道你怎么跟老板汇报工作。看几本bioinfo
    的书,如果你觉得你能做,你就做下去,你要是觉得困难太多,趁早该行。做bioinfo,
    没人帮得了你,自己靠自己。
    我又想起来几天前北京的一个朋友说得:现在有个误区,以为人人都可以做bioinfo。。
    。我偷偷地笑ing
    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    :     我想,bioinformatics是通过计算机和信息学的工具和手段,结合数学、物理等学科
    : 的知识通过建立各种模型解决生命科学里的各种问题,模型建立起来可以被生命科学工作
    : 这利用其他生化手段验证,然后在各领域得到应用。从而推动生命科学乃至整个人类社会
    : 的发展。bioinfo里面有各种各样的工具软件,当然绝大部分我都没有掌握,因为我还只
    : 是在空想阶段。我想有一部分bioinfo的人员还是搞软件开发和应用的吧。我大致看过各
    : 学院bioinfo的研究方向,我个人只想做生命科学的理论研究。
    :     也许有不少漏掉的,等我想起来再补充。当然怎么敢在师兄面前谈深刻?
    :     之所以是interdiciplinary应该是因为需要用到多学科的知识吧。
    :     也许说我得了“妄想症”倒更确切些。平时说我想法奇怪的朋友和同学甚至老师多了
    : 。
    : ...........................

    ───────────────────────────────────────
    作者  aroluna (☆小蟹成仙·好好修炼☆), 信区: Bioinformatics                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:39:34 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    你不要这么说
    你有师兄可以咨询
    他可没有
    我觉得他至少勇气可嘉
    而且他在别的方面的实力也许你没有看到
    这个只是基础不同而已

    闻道先后而已
    为了理想执着追求的人,我敬佩
    尽管不一定很牛

    【 在 lylover (石之轩) 的大作中提到: 】
    : 管别人说你什么?不用理那么多。看看你自己适合做什么。
    : 你在网上转了半天,好像还是在找门吧?不知道你怎么跟老板汇报工作。看几本bioinfo
    : 的书,如果你觉得你能做,你就做下去,你要是觉得困难太多,趁早该行。做bioinfo,
    : 没人帮得了你,自己靠自己。
    : 我又想起来几天前北京的一个朋友说得:现在有个误区,以为人人都可以做bioinfo。。
    : 。我偷偷地笑ing

    ───────────────────────────────────────
    作者  lylover (石之轩), 信区: Bioinformatics                                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:47:03 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    哎,你看看,急了吧。。。
    他有他的想法,我有我的思路啊,他既然在网上谈他的想法,我就在网上谈自己的心得。
    要是看了他的帖子我也不吭声,岂不是不大好?
    他有没有师兄,不管我的事,他有没有值得嘉许,我没有资格评价,他有没有别的方面的
    实力,呵呵,我管好自己的事情。
    我只是说一个意思:要有东西。sigh...现在缺的就这个了。。。

    【 在 aroluna (☆小蟹成仙·好好修炼☆) 的大作中提到: 】
    : 你不要这么说
    : 你有师兄可以咨询
    : 他可没有
    : 我觉得他至少勇气可嘉
    : 而且他在别的方面的实力也许你没有看到
    : 这个只是基础不同而已
    : 闻道先后而已
    : 为了理想执着追求的人,我敬佩
    : 尽管不一定很牛

    ───────────────────────────────────────
    作者  lylover (石之轩), 信区: Bioinformatics                                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:48:14 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    你又犯嗔戒了。。。他说他的嘛。。呵呵。继续说你的理想。
    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    Please tell me why?  I won't be stupid again!
    Thank you!!
    【 在 invoker (junkDNA) 的大作中提到: 】
    : interesting question, crazy( or stupid ?)idea.
    : :)

    ───────────────────────────────────────
    作者  lazy (draughts), 信区: Bioinformatics                                  
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:48:49 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    其实我总觉得很多一般大学出不了好成果的关键是在于信息太闭塞
    【 在 aroluna (☆小蟹成仙·好好修炼☆) 的大作中提到: 】
    : 你不要这么说
    : 你有师兄可以咨询
    : 他可没有
    : 我觉得他至少勇气可嘉
    : 而且他在别的方面的实力也许你没有看到
    : 这个只是基础不同而已
    : 闻道先后而已
    : 为了理想执着追求的人,我敬佩
    : 尽管不一定很牛

    ───────────────────────────────────────
    作者  lylover (石之轩), 信区: Bioinformatics                                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:52:19 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    他不是要请人吃饭吧?
    【 在 aroluna (☆小蟹成仙·好好修炼☆) 的大作中提到: 】
    great
    modeling?admire啊:)

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    : Thank you!
    : I wish one day I have a chance to gather scientist all over the world to make
    :  it out.  
    : That may be actually crazy!
    : But I'm really good at modeling,I think.

    ───────────────────────────────────────
    作者  badgee (天篷), 信区: Bioinformatics                                    
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日17:59:35 星期六) , 站内信件                  
    ───────────────────────────────────────
    Thanks to lylover!
    I think I can  do a god job in bioinformatics. Because, I have a dream of mak
    e out the real of life.  There are two ways for me to take. One is phylosophy
    , the other is life science.  I believe , in phylosophy I cannot find the ans
    wer of my queston.  So I have to find it in Life Science.  
    I am good at mathematical modeling and computer programming.
    My major is chemical Technology.  And I am creative.
    With all these abilities, there's no doubt that   I can do a good  job in bio
    informatics.

    【 在 lylover (石之轩) 的大作中提到: 】
    : 管别人说你什么?不用理那么多。看看你自己适合做什么。
    : 你在网上转了半天,好像还是在找门吧?不知道你怎么跟老板汇报工作。看几本bioinfo
    : 的书,如果你觉得你能做,你就做下去,你要是觉得困难太多,趁早该行。做bioinfo,
    : 没人帮得了你,自己靠自己。
    : 我又想起来几天前北京的一个朋友说得:现在有个误区,以为人人都可以做bioinfo。。
    : 。我偷偷地笑ing

    ───────────────────────────────────────
    作者  badgee (天篷), 信区: Bioinformatics                                    
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日18:11:58 星期六) , 站内信件                  
    ───────────────────────────────────────
    lylover 师兄千万不要误解啊!
    我哪里有money去腐败啊?

    【 在 lylover (石之轩) 的大作中提到: 】
    : 他不是要请人吃饭吧?
    : great
    : modeling?admire啊:)

    ───────────────────────────────────────
    作者  lylover (石之轩), 信区: Bioinformatics                                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日18:26:27 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    哦?good at programming?好羡慕啊,我现在就缺这个跟统计了。sigh...至少要花个一
    年的时间学习。
    所以我觉得你只要把生物的知识补充一下,再看看目前的bioinfo的现状。嗯,呵呵,我
    就比不了了。所以对自己有信心点。没问题的。
    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    : Thanks to lylover!
    : I think I can  do a god job in bioinformatics. Because, I have a dream of mak
    : e out the real of life.  There are two ways for me to take. One is phylosophy
    : , the other is life science.  I believe , in phylosophy I cannot find the ans
    : wer of my queston.  So I have to find it in Life Science.  
    : I am good at mathematical modeling and computer programming.
    : My major is chemical Technology.  And I am creative.
    : With all these abilities, there's no doubt that   I can do a good  job in bio
    : informatics.

    ───────────────────────────────────────
    作者  lylover (石之轩), 信区: Bioinformatics                                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日18:27:57 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    打住!我最恨人家叫我师兄。我有这么老嘛?嘻嘻嘻嘻。
    没有money我可以借给你啊,利钱不多的,而且,只要还利钱就可以了,嘻嘻。
    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    lylover 师兄千万不要误解啊!
    我哪里有money去腐败啊?

    【 在 lylover (石之轩) 的大作中提到: 】
    : 他不是要请人吃饭吧?
    : great
    : modeling?admire啊:)

    ───────────────────────────────────────
    作者  lylover (石之轩), 信区: Bioinformatics                                 
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日18:45:07 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    回到这个问题本身。有研究这方面的。有编程性死亡的基因在起作用。其他诸如衰老因子
    等。我有个建议,badgee可以搜索一下,看看有多少的编程性死亡的基因,预测一下。然
    后做做进化分析。不过好像有人做了。这里:

    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids
    =11516343&dopt=Abstract

    1: Genome Biol. 2001;2(7):REVIEWS3009. Epub 2001 Jul 05. Related Articles,
    Links  

      
    Inhibitor of apoptosis proteins and their relatives: IAPs and other BIRPs.

    Verhagen AM, Coulson EJ, Vaux DL.

    The Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, Post Office, Royal
    Melbourne Hospital, Victoria 3050, Australia. verhagen@wehi.edu.au

    SUMMARY: Apoptosis is a physiological cell death process important for
    development, homeostasis and the immune defence of multicellular animals.
    The key effectors of apoptosis are caspases, cysteine proteases that cleave
    after aspartate residues. The inhibitor of apoptosis (IAP) family of
    proteins prevent cell death by binding to and inhibiting active caspases and
    are negatively regulated by IAP-binding proteins, such as the mammalian
    protein DIABLO/Smac. IAPs are characterized by the presence of one to three
    domains known as baculoviral IAP repeat (BIR) domains and many also have a
    RING-finger domain at their carboxyl terminus. More recently, a second group
    of BIR-domain-containing proteins (BIRPs) have been identified that includes
    the mammalian proteins Bruce and Survivin as well as BIR-containing proteins
    in yeasts and Caenorhabditis elegans. These Survivin-like BIRPs regulate
    cytokinesis and mitotic spindle formation. In this review, we describe the
    IAPs and other BIRPs, their evolutionary relationships and their subcellular
    and tissue localizations.
    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
        生命的存在,由生物化学反应维持,生物个体有规律地按照某个程序生、老、病、死

    ,然而,这个程序的完全由protein来执行,根据中心法则归根到底都是有DNA决定的。亦

    或可说成是某些gene决定的,控制的究竟是哪些片段(gene)?
        这个星球上有没有人在研究这个问题?
        生命的奥秘可以通过bioinfo解读吗?
        

    ───────────────────────────────────────
    作者  Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了), 信区: Bioinformatics               
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日20:11:31 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    其实gene本身的功能以至何时何地行使这些功能都不是单独由这些基因决定的,至少我知
    道在神经系统中不是这样

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    :     生命的存在,由生物化学反应维持,生物个体有规律地按照某个程序生、老、病、死
    : ,然而,这个程序的完全由protein来执行,根据中心法则归根到底都是有DNA决定的。亦
    : 或可说成是某些gene决定的,控制的究竟是哪些片段(gene)?
    :     这个星球上有没有人在研究这个问题?
    :     生命的奥秘可以通过bioinfo解读吗?

    ───────────────────────────────────────
    作者  boen (boen毕业乐!), 信区: Bioinformatics                              
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日20:32:41 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    生命可能并没有一套精确的程序在控制,它是一个不确定的
    自组织系统,很多控制环节都有个概率问题,以后说不定某位
    牛人用量子力学解析它的本质。

    【 在 Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了) 的大作中提到: 】
    : 其实gene本身的功能以至何时何地行使这些功能都不是单独由这些基因决定的,至少我知
    : 道在神经系统中不是这样

    ───────────────────────────────────────
    作者  badgee (天篷), 信区: Bioinformatics                                    
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日21:11:19 星期六) , 站内信件                  
    ───────────────────────────────────────
      也许微观上看来,很多生命过程存在概率问题,甚至有人曾经直接把生命科学归结为
    统计学问题,
      但从宏观上来讲,生命的整个历程一定存在程序性,就象历史一样,象着特定的阶段
    发展,也就是合力的作用。谁也改变不了!众多不确定的背后总存在一个确定的因素,就
    是那个程序。
      

    【 在 boen (boen毕业乐!) 的大作中提到: 】
    : 生命可能并没有一套精确的程序在控制,它是一个不确定的
    : 自组织系统,很多控制环节都有个概率问题,以后说不定某位
    : 牛人用量子力学解析它的本质。

    ───────────────────────────────────────
    作者  Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了), 信区: Bioinformatics               
    标题  Re: 有研究程序性死亡的吗?                                             
    时间  北大未名站 (2003年10月04日21:49:28 星期六), 转信                       
    ───────────────────────────────────────
    呵呵,又一个抽象的坑。。。

    【 在 badgee (天篷) 的大作中提到: 】
    :   也许微观上看来,很多生命过程存在概率问题,甚至有人曾经直接把生命科学归结为
    : 统计学问题,
    :   但从宏观上来讲,生命的整个历程一定存在程序性,就象历史一样,象着特定的阶段
    : 发展,也就是合力的作用。谁也改变不了!众多不确定的背后总存在一个确定的因素,就
    : 是那个程序。
    :   


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