1)设置Graphviz的路径可以在程序里面修改.
protege 3和protege 4 都是一样的方法.
进入程序后
在OWLViz的标签栏里面 的
option 里面设置.
dot application  path 里面设置成你安装 Graphviz 的位置并指向 dot.exe文件
例如
C:\Program Files\Graphviz2.26\bin\dot.exe
2)如果出现DOT错误，可以试试在c:\program files\目录下建一个ATT文件夹，然后把graphiz文件夹整个拷贝到\ATT目录下，应该就没问题了。忘了这是哪个前辈的经验，我看过后记下来的，呵呵。
3)之前一直照着网上说在安装目录中改配置，根本不管用
出现dot error对话框，一路确定把它点没，然后去Owlviz标签，找到options，然后设置路径graphviz下的bin---dot
4)  此法在Protege 3里不管用了。正确方法是：进入OWLViz选项卡，然后在OWLViz工具条里点击Option按钮，然后选择正确的        dot.exe路径。