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--  作者：admin
--  发布时间：9/23/2004 2:05:00 AM

--  生物信息学需要掌握哪些算法？


【合集】需要掌握哪些算法？            


发信人: xwp (小巫婆), 信区: Bioinformatics
标  题: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月20日13:32:23 星期六) , 站内信件

请大家帮忙指教哦
谢谢

--
安住在当下！娑婆既是净土！
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.204.36.80]
发信人: aaman (谁说我不在乎), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月20日16:40:46 星期六), 转信

偶只听说过一个HMM(好像是隐马尔科夫链)
其它的其他的我也没听说过
很惭愧的说，因为偶也没有正式学习
不过多看看北大的生物信息网站吧
上面很多的专业知识的说


【 在 xwp (小巫婆) 的大作中提到: 】
: 请大家帮忙指教哦
: 谢谢


--
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.113.24.109]
发信人: boolean (酸杏儿), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月20日18:35:03 星期六), 转信

我觉得最重要的算法就是动态规划算法，
另外还有聚类里用到的算法
还有几个模型，比如神经网络和隐马尔可夫模型（Hidden Markov Models）
统计学基础比较重要
【 在 xwp (小巫婆) 的大作中提到: 】
: 请大家帮忙指教哦
: 谢谢


--
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.113.31.41]
发信人: xwp (小巫婆), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月20日20:18:28 星期六) , 站内信件

哎呀，我很笨的拉
动态规划算法和隐马尔可夫模型是什么东东？
介绍一两本书或者简单介绍一下好么？
谢谢啦^_*
【 在 boolean (酸杏儿) 的大作中提到: 】
: 我觉得最重要的算法就是动态规划算法，
: 另外还有聚类里用到的算法
: 还有几个模型，比如神经网络和隐马尔可夫模型（Hidden Markov Models）
: 统计学基础比较重要


--
安住在当下！娑婆既是净土！
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.204.36.80]
发信人: chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日11:40:32 星期天), 转信

去查文献
waterman smith这帮人的
或者去ftp.glove.dhs.org上面有个文件夹 computational biology经典文献。

这个还跟你专业背景有关 如果你是自动化或者计算机出身，搞算法开发当然有优势
如果是生物专业出身，那就偏向应用好了，利用开发好的算法应用于生物学问题。


【 在 xwp (小巫婆) 的大作中提到: 】
: 哎呀，我很笨的拉
: 动态规划算法和隐马尔可夫模型是什么东东？
: 介绍一两本书或者简单介绍一下好么？
: 谢谢啦^_*


--
乐莫大于心死

[m※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 166.111.175.88]
发信人: boolean (酸杏儿), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日12:29:11 星期天), 转信

隐马尔可夫模型最早是用在语音识别里的，
最经典的一篇介绍隐马尔可夫的文章是L.R.Rabiner的
An Introduction to Hidden Markov Models
动态规划算法并不是一个算法，而是使用动态规划思想的一套算法
比如Smith-Waterman算法等，重要的是了解动态规划的思想而不是某一个算法
【 在 xwp (小巫婆) 的大作中提到: 】
: 哎呀，我很笨的拉
: 动态规划算法和隐马尔可夫模型是什么东东？
: 介绍一两本书或者简单介绍一下好么？
: 谢谢啦^_*


--
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.113.30.48]
发信人: testsaf (像不像一条船), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日14:15:31 星期天), 转信

没找到你说的这个文件夹

【 在 chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道) 的大作中提到: 】
: 去查文献
: waterman smith这帮人的
: 或者去ftp.glove.dhs.org上面有个文件夹 computational biology经典文献。
: 这个还跟你专业背景有关 如果你是自动化或者计算机出身，搞算法开发当然有优势
: 如果是生物专业出身，那就偏向应用好了，利用开发好的算法应用于生物学问题。


--

玩玩儿…… :)

※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 162.105.78.122]
发信人: chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日14:22:35 星期天), 转信

就在ftp.glove.dhs.org/生物文献/classic articles in computational biology 阿
不会看不见吧

【 在 testsaf (像不像一条船) 的大作中提到: 】
: 没找到你说的这个文件夹


--
乐莫大于心死

[m※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 166.111.175.88]
发信人: xwp (小巫婆), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日14:25:15 星期天) , 站内信件

谢啦！^_^
【 在 chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道) 的大作中提到: 】
: 去查文献
: waterman smith这帮人的
: 或者去ftp.glove.dhs.org上面有个文件夹 computational biology经典文献。
: 这个还跟你专业背景有关 如果你是自动化或者计算机出身，搞算法开发当然有优势
: 如果是生物专业出身，那就偏向应用好了，利用开发好的算法应用于生物学问题。


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安住在当下！娑婆既是净土！
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.204.36.80]
发信人: xwp (小巫婆), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日14:25:43 星期天) , 站内信件

我看见了阿
【 在 chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道) 的大作中提到: 】
: 就在ftp.glove.dhs.org/生物文献/classic articles in computational biology 阿
: 不会看不见吧


--
安住在当下！娑婆既是净土！
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发信人: xwp (小巫婆), 信区: Bioinformatics
标  题: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月20日13:32:23 星期六) , 站内信件

请大家帮忙指教哦
谢谢

--
安住在当下！娑婆既是净土！
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.204.36.80]
发信人: aaman (谁说我不在乎), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月20日16:40:46 星期六), 转信

偶只听说过一个HMM(好像是隐马尔科夫链)
其它的其他的我也没听说过
很惭愧的说，因为偶也没有正式学习
不过多看看北大的生物信息网站吧
上面很多的专业知识的说


【 在 xwp (小巫婆) 的大作中提到: 】
: 请大家帮忙指教哦
: 谢谢


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发信人: boolean (酸杏儿), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月20日18:35:03 星期六), 转信

我觉得最重要的算法就是动态规划算法，
另外还有聚类里用到的算法
还有几个模型，比如神经网络和隐马尔可夫模型（Hidden Markov Models）
统计学基础比较重要
【 在 xwp (小巫婆) 的大作中提到: 】
: 请大家帮忙指教哦
: 谢谢


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※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.113.31.41]
发信人: xwp (小巫婆), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月20日20:18:28 星期六) , 站内信件

哎呀，我很笨的拉
动态规划算法和隐马尔可夫模型是什么东东？
介绍一两本书或者简单介绍一下好么？
谢谢啦^_*
【 在 boolean (酸杏儿) 的大作中提到: 】
: 我觉得最重要的算法就是动态规划算法，
: 另外还有聚类里用到的算法
: 还有几个模型，比如神经网络和隐马尔可夫模型（Hidden Markov Models）
: 统计学基础比较重要


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安住在当下！娑婆既是净土！
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.204.36.80]
发信人: chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日11:40:32 星期天), 转信

去查文献
waterman smith这帮人的
或者去ftp.glove.dhs.org上面有个文件夹 computational biology经典文献。

这个还跟你专业背景有关 如果你是自动化或者计算机出身，搞算法开发当然有优势
如果是生物专业出身，那就偏向应用好了，利用开发好的算法应用于生物学问题。


【 在 xwp (小巫婆) 的大作中提到: 】
: 哎呀，我很笨的拉
: 动态规划算法和隐马尔可夫模型是什么东东？
: 介绍一两本书或者简单介绍一下好么？
: 谢谢啦^_*


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乐莫大于心死

[m※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 166.111.175.88]
发信人: boolean (酸杏儿), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日12:29:11 星期天), 转信

隐马尔可夫模型最早是用在语音识别里的，
最经典的一篇介绍隐马尔可夫的文章是L.R.Rabiner的
An Introduction to Hidden Markov Models
动态规划算法并不是一个算法，而是使用动态规划思想的一套算法
比如Smith-Waterman算法等，重要的是了解动态规划的思想而不是某一个算法
【 在 xwp (小巫婆) 的大作中提到: 】
: 哎呀，我很笨的拉
: 动态规划算法和隐马尔可夫模型是什么东东？
: 介绍一两本书或者简单介绍一下好么？
: 谢谢啦^_*


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※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.113.30.48]
发信人: testsaf (像不像一条船), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日14:15:31 星期天), 转信

没找到你说的这个文件夹

【 在 chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道) 的大作中提到: 】
: 去查文献
: waterman smith这帮人的
: 或者去ftp.glove.dhs.org上面有个文件夹 computational biology经典文献。
: 这个还跟你专业背景有关 如果你是自动化或者计算机出身，搞算法开发当然有优势
: 如果是生物专业出身，那就偏向应用好了，利用开发好的算法应用于生物学问题。


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发信人: chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日14:22:35 星期天), 转信

就在ftp.glove.dhs.org/生物文献/classic articles in computational biology 阿
不会看不见吧

【 在 testsaf (像不像一条船) 的大作中提到: 】
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发信人: xwp (小巫婆), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日14:25:15 星期天) , 站内信件

谢啦！^_^
【 在 chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道) 的大作中提到: 】
: 去查文献
: waterman smith这帮人的
: 或者去ftp.glove.dhs.org上面有个文件夹 computational biology经典文献。
: 这个还跟你专业背景有关 如果你是自动化或者计算机出身，搞算法开发当然有优势
: 如果是生物专业出身，那就偏向应用好了，利用开发好的算法应用于生物学问题。


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安住在当下！娑婆既是净土！
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 202.204.36.80]
发信人: xwp (小巫婆), 信区: Bioinformatics
标  题: Re: 生物信息学需要掌握哪些算法？
发信站: 北大未名站 (2002年04月21日14:25:43 星期天) , 站内信件

我看见了阿
【 在 chevalier (土土游侠◎挖坑灌水，无非妙道) 的大作中提到: 】
: 就在ftp.glove.dhs.org/生物文献/classic articles in computational biology 阿
: 不会看不见吧


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安住在当下！娑婆既是净土！
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