[合集]精品推荐—Bayesian, protein-prot

发信人: kingsyl (Molecular Machine To Be Studied), 信区: Bioinformatics
标  题: [合集]精品推荐—Bayesian, protein-prot
发信站: 北大未名站 (2004年03月21日20:13:20 星期天), 站内信件

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作者  lylover (阅读R文档ing&思念cinderella), 信区: Bioinformatics            
标题  精品推荐——Bayesian, protein-protein interaction                      
时间  北大未名站 (2003年10月19日04:54:28 星期天) , 站内信件                  
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老板刚推荐的science文章，推荐一下。白天再仔细看吧。

A Bayesian Networks Approach for Predicting Protein-Protein
Interactions from Genomic Data

Ronald Jansen,1* Haiyuan Yu,1 Dov Greenbaum,1 Yuval Kluger,1Nevan J. Krogan,4
Sambath Chung,1,2 Andrew Emili,4Michael Snyder,2 Jack F. Greenblatt,4 Mark G
erstein1,3†

We have developed an approach using Bayesian networks to predict protein-prot
ein interactions genome-wide in yeast. Our method naturally weights and combi
nes into reliable predictions genomic features only weakly associated with in
teraction (e.g., messenger RNAcoexpression, coessentiality, and co-localizati
on). In addition to de novo predictions, it can integrate often noisy,experim
ental interaction data sets. We observe that at given levels of sensitivity,
our predictions are more accurate than the existing high-throughput experimen
tal data sets. We validate our predictions with TAP (tandem affinity pu
rification) tagging experiments. Our analysis, which gives a comprehens
ive view of yeast interactions, is available at genecensus.org/intint.

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作者  biomagic (sophie's), 信区: Bioinformatics                              
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein intera...                    
时间  北大未名站 (2003年10月20日11:33:50 星期一), 转信                       
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Gerstein实验室的啊。
第二作者原来是我的下铺

【 在 lylover (阅读R文档ing&思念cinderella) 的大作中提到: 】
: 老板刚推荐的science文章，推荐一下。白天再仔细看吧。
: A Bayesian Networks Approach for Predicting Protein-Protein
: Interactions from Genomic Data
: Ronald Jansen,1* Haiyuan Yu,1 Dov Greenbaum,1 Yuval Kluger,1Nevan J. Krogan,4
:  Sambath Chung,1,2 Andrew Emili,4Michael Snyder,2 Jack F. Greenblatt,4 Mark G
: erstein1,3†
: We have developed an approach using Bayesian networks to predict protein-prot
: ein interactions genome-wide in yeast. Our method naturally weights and combi
: nes into reliable predictions genomic features only weakly associated with in
: teraction (e.g., messenger RNAcoexpression, coessentiality, and co-localizati
: ...........................

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作者  chevalier (游侠◎为THU哭泣), 信区: Bioinformatics                      
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日11:51:42 星期一), 转信                       
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这就是差距阿...sigh
【 在 biomagic (sophie's) 的大作中提到: 】
: Gerstein实验室的啊。
: 第二作者原来是我的下铺

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作者  kokolu (岁月如歌), 信区: Bioinformatics                                
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日13:24:52 星期一), 转信                       
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sigh
【 在 biomagic (sophie's) 的大作中提到: 】
: Gerstein实验室的啊。
: 第二作者原来是我的下铺

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作者  oyel (let it be), 信区: Bioinformatics                                 
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein intera...                    
时间  北大未名站 (2003年10月20日17:25:43 星期一) , 站内信件                  
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:)
很奇怪只有Gerstein一个是CS的啊

【 在 biomagic (sophie's) 的大作中提到: 】
: Gerstein实验室的啊。
: 第二作者原来是我的下铺

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作者  Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了), 信区: Bioinformatics               
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日19:32:04 星期一), 转信                       
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怎么听着像那个经典的调侃： “清华/北大距离世界一流大学多远？”

呵呵

【 在 chevalier (游侠◎为THU哭泣) 的大作中提到: 】
:  这就是差距阿...sigh

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作者  hek (From CS to DS), 信区: Bioinformatics                              
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日22:50:33 星期一), 转信                       
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这个问题很复杂

【 在 Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了) 的大作中提到: 】
: 怎么听着像那个经典的调侃： “清华/北大距离世界一流大学多远？”
: 呵呵

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作者  Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了), 信区: Bioinformatics               
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日23:13:02 星期一), 转信                       
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hehe,不是说什么“出西门/东门向南/北三百米”吗？

【 在 hek (From CS to DS) 的大作中提到: 】
: 这个问题很复杂

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作者  chevalier (游侠◎为THU哭泣), 信区: Bioinformatics                      
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日23:19:53 星期一), 转信                       
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呵呵 这个是经典
不过我sigh的是呆国内和出去区别so大

【 在 Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了) 的大作中提到: 】
: hehe,不是说什么“出西门/东门向南/北三百米”吗？

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作者  Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了), 信区: Bioinformatics               
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日23:26:35 星期一), 转信                       
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怎么？你保老孙那儿了？

【 在 chevalier (游侠◎为THU哭泣) 的大作中提到: 】
: 呵呵 这个是经典
: 不过我sigh的是呆国内和出去区别so大

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作者  biomagic (sophie's), 信区: Bioinformatics                              
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日23:37:17 星期一), 转信                       
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physics

【 在 oyel (let it be) 的大作中提到: 】
: :)
: 很奇怪只有Gerstein一个是CS的啊

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作者  biomagic (sophie's), 信区: Bioinformatics                              
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日23:39:42 星期一), 转信                       
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是啊。
自己也惭愧的紧。
想想舒适的生活，惰性又抬头了。
：P
【 在 chevalier (游侠◎为THU哭泣) 的大作中提到: 】
: 呵呵 这个是经典
: 不过我sigh的是呆国内和出去区别so大

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作者  lylover (阅读R文档ing&思念cinderella), 信区: Bioinformatics            
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月20日23:43:58 星期一), 转信                       
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现实又不是一时半会儿就能改变的。慨叹干吗呢，还是努力工作重要。

【 在 chevalier (游侠◎为THU哭泣) 的大作中提到: 】
呵呵 这个是经典
不过我sigh的是呆国内和出去区别so大

【 在 Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了) 的大作中提到: 】
: hehe,不是说什么“出西门/东门向南/北三百米”吗？

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作者  oyel (let it be), 信区: Bioinformatics                                 
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日01:01:26 星期二), 转信                       
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哦，01年还有一篇钱江的JMB

【 在 biomagic (sophie's) 的大作中提到: 】
: physics

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作者  hek (From CS to DS), 信区: Bioinformatics                              
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日01:28:05 星期二), 转信                       
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在国内就是犯懒

【 在 biomagic (sophie's) 的大作中提到: 】
: 是啊。
: 自己也惭愧的紧。
: 想想舒适的生活，惰性又抬头了。
: ：P

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作者  hek (From CS to DS), 信区: Bioinformatics                              
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日01:28:54 星期二), 转信                       
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钱江不就是Fang的那几篇牛人传之一么？

【 在 oyel (let it be) 的大作中提到: 】
: 哦，01年还有一篇钱江的JMB

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作者  lylover (阅读R文档ing&思念cinderella), 信区: Bioinformatics            
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日05:27:18 星期二), 转信                       
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呵呵，很ft，懒还有理由？有句古话说的好啊：男人不懒，女人不看。是吧。。。

【 在 hek (From CS to DS) 的大作中提到: 】
: 在国内就是犯懒

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作者  chevalier (游侠◎为THU哭泣), 信区: Bioinformatics                      
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日11:16:49 星期二), 转信                       
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慨叹是人之常情嘛 呵呵
看见同学都在nature上发paper了自己还哼持哼持费劲攒JMB能不慨叹嘛
【 在 lylover (阅读R文档ing&思念cinderella) 的大作中提到: 】
: 现实又不是一时半会儿就能改变的。慨叹干吗呢，还是努力工作重要。
: 呵呵 这个是经典
: 不过我sigh的是呆国内和出去区别so大

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作者  chevalier (游侠◎为THU哭泣), 信区: Bioinformatics                      
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日11:17:06 星期二), 转信                       
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你怎么不参加你们蛋白质会议跑来灌水啊
【 在 Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了) 的大作中提到: 】
: 怎么？你保老孙那儿了？

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作者  tonydudu (xanadu), 信区: Bioinformatics                                
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日14:32:13 星期二), 转信                       
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为THU哭泣什么？
【 在 chevalier (游侠◎为THU哭泣) 的大作中提到: 】
: 你怎么不参加你们蛋白质会议跑来灌水啊

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作者  Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了), 信区: Bioinformatics               
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日18:36:50 星期二), 转信                       
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呵呵，这几天重病，休息：）

今天第一天，早上讲的都是老调调，Huber的这个topic偶都听了2回了。。。下午倒是有
看起来挺8错的报告，可惜偶肯定听不懂:( ,明天的更没劲，算了，前两界的热闹看够了
，呵呵

【 在 chevalier (游侠◎为THU哭泣) 的大作中提到: 】
: 你怎么不参加你们蛋白质会议跑来灌水啊

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作者  invoker (junkDNA), 信区: Bioinformatics                                
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日20:37:50 星期二), 转信                       
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P.J.Bjorkman的不错，

【 在 Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了) 的大作中提到: 】
: 呵呵，这几天重病，休息：）
: 今天第一天，早上讲的都是老调调，Huber的这个topic偶都听了2回了。。。下午倒是有
: 看起来挺8错的报告，可惜偶肯定听不懂:( ,明天的更没劲，算了，前两界的热闹看够了
: ，呵呵

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作者  Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了), 信区: Bioinformatics               
标题  Re: 精品推荐——Bayesian, protein-protein in...                        
时间  北大未名站 (2003年10月21日20:46:34 星期二), 转信                       
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表刺激我啦，偶只是给偷懒找个借口嘛：）

【 在 invoker (junkDNA) 的大作中提到: 】
: P.J.Bjorkman的不错，